label в мультиполигоне ставится в type=boundary только если нет admin_centre, то есть если это не АТЕ, а например микрорайоны, посёлки, кварталы, городки, массивы, ЖСК и так далее. При надлежащей разметке JOSM не должен ругаться на label в отношении. Какая у вас версия JOSM? У меня вот все проверки включены, часто размечаю такие объекты, никаких предупреждений и ошибок...
Я имел ввиду что ругается если label используется в type=multipolygon