До того,как почистил рут возможно и был в норме. Беда в том,что папка grub опустела. В попытках освободить место для кромсания раздела с целью бэкапа папки пользователя рутовую почистил.
Т.е. последовательность: -ошибка загрузки -попытка восстановления загрузчика -попытка восстановления раздела -отрезание куска и форматирование его в ext4 -полное помирание