Там на плате usb-usart, в МК это usart3. После make нужно ещё скрипт запустить, чтоб бинарник пошифровать
Что-то я опять туплю. По X настроил всё, получилось: microsteps: 16
rotation_distance: 80
По Y тоже самое прописано, но если его заставить проехать на 10мм, он едет не на 10 мм. Опираюсь на данные из марли, что при 16 микрошагах, у нас 80 шагов на мм