Согласовывать акт ни с кем не надо. В ФСТЭК необходимо направит всего два документа:
1. Перечень ОКИИ, подлежащих категорированию (его, к слову, в некоторых случаях надо согласовывать со своей, условно говоря, вышестоящей организацией (при ее наличии)).
2. Заронённую форму из 236 приказа ФСТЭК.