а можно как-то в Cura выставить меньшую скорость для оси Y и большую для Х?
Кура выделяет только Z https://ultimaker.com/en/resources/52664-speed Но можно попробовать самому разместить M203 в стартовый gcode и ограничить таким образом. Убедитесь только, что кура позже не переписывает Ваше значение своими.