Это может быть как проблемой механики фидера (слишком сильный прижим, например), так и проблемой экструдера (когда фидеру тяжело проталкивать пруток через подплавленный кончик трубки, например, то он также будет его деформировать).
Хотэнд перебирать, смотреть нет ли там явной пробки от недовставленной трубки боудена, кончик трубки деформированный пока подрезать чуток, а так всю под замену, прижим в фидере если регулируется - попробовать уменьшить.