думал может где то в базе информация осталась после удаления МС, очень странная ситуация на счет вопроса о том, что не отправляются письма от СКОМ, так выяснил что это проблема МС03, после удаления его с пула "Notifications Resource Pool" все письма начали отправляться + заработал мониторинг линукс агентов