На серверной части только лицензирование будет для платной версии, хотя скорей всего лицензирование будет в самом приложении. Потому что, те кто не захотят платить за расширенную версию и так не заплатят
Открою тайну, ваше приложение декомпилится, патчится, дампится полная версия. Даже если закроете сверху какой-то Themida. Я софт для пк с 2005 пишу, знаю что говорю.