Если на Яндексе брать, то заплатишь сразу 2 комиссии - сначала UFS за покупку билета вне официальных ресурсов РЖД, а потом сбор АСУ Экспресс-3 за бронирование
Без сбора UFS можно купить на сайте или в кассе (правда, в кассе на 1 рубль дороже любой билет с динамическим ценообразованием - не знаю, почему, но так работает), без сбора АСУ Э-3 - то ли вообще нигде, то ли у проводника при посадке на станции, на которой нет билетных касс (правда, таких станций по всей РФ наберётся хорошо если сотня).