Не, если НДФЛ платит работодатель, то по месту регистрации предприятия, а вот на остальное по месту жительства то есть доходы от продажи/сдачи в аренду имущества, доходы от источников за пределами РФ и прочие.
Пенягино ходило себе в Митино. Запуск МЦД перераспределил пасспотоки, но вряд ли много людей из-за запуска МЦД сменило работу в области на работу в Москве