сервер телеги может в лонг-поллинг, сильно не страдает. для серверов одна из проблем вебхуков состоит в гарантии доставки этих хуков (+1 ненужное хранилище).
в смысле проблема доставки? с лонг поллингом ты уже делаешь своё приложение медленнее на .1-.2 секунды