в том что инсталлер пишет бут директом, и к нему не переприменяется хак amonet который дописывает twrp и отрубает dm-verify возможно. когда ты пишешь архивы из twrp - он последними пунктами всегда себя типа восстанавливает (в рамдиске или буте)
Может про это сообщить разрабам иагиска или это слишком сложно будет править, там вроде стоит по умолчанию галка обновлять автоматом в магиске, если так то потихоньку будут появляться бутлупы