Проблем не будет, т.к application класс приложения живёт дольше всех , следовательно умрёт в последнюю очередь. Если бы вы наследовались от обычной viewmodel и в конструктор передавали бы контекст, который являлся бы контекстом вашей вьюхи (фрагмент или активити), то при повороте ваша вью не умирает, т.к viewmodel держит ссылку на неё.