У меня в голове есть идея аля
- делаем короче для каждого файла^оси ветку на гите, чтоб иметь возможность их отдельно выкачивать
- делаем какой-то простой конфиг файл с пакетами, которые хочу поставить и куда, и с пакетами которые игнорить
- качаем то, что не в игноре
- как-то обновляем то, что не в игноре