Короче есть симптомы следующего характера: на 19.15.3 и даже вроде на 20.3. Есть реплицируемая таблица ReplicatedMergeTree на кластере 2х2 небольшого размера.(поэтому и нашли, что небольшая) добавляем туда строки. потом удаляем с помощью ДДЛ типа ALTER TABLE XXX DELETE WHERE condtion, где condition достаточно сложный и затрагивает оба шарда и больше партиции. Проверяем - иногда не все строки из условия удалились. Если это произошло - вставляем строки. КХ говорит, что все ок, но если взять селект, то не все строки вставились. Идем в зукипер там и видим, что зукипер информирует КХ, что нод, что он запрашивает - уже существует. удаляем ноду и заново вставляем и тут уже вставляется.