Can you please show what query you have problem with?

Select c.materialized_col, count() from connection c join message m on m.cid=c.cid join delivery d on d.cid=c.cid group by c.materialized_col

actually "...join delivery d on d.mid=m.mid" if it makes difference

and which column is missing? in error message?

materialized_col

If i skip the join of delivery table, it works fine

what is the materialized_col? can you show its definition?

also check https://altinity.com/blog/2020-07-14-joins-in-clickhouse-materialized-views maybe it will help

materialized_col lowcardinality(text) materialized cast(...)

This is a materialized column, not view btw

А какие примерно рекомендации есть на размер партиции по объему на диске? Хотя бы порядок: сотни Мб, Гб, десятки Гб ?
Про месячное партиционирование помню, но, я как раз, наоборот, думаю делать квартальное или годовое...

42ГБ идеал.
а по умолчанию вроде 130ГБ на парт.

Смысл делать одну партицию больше чем 100ГБ наверно мало в общих случаях.
но партиции это больше про логическую организацию.
партиции лучше делать исходя из запросов и управления данными.

можете вообще не делать партиции...

Дратуте! Есть где-то 100 млн строк. По ним надо посчитать формулу со всеми комбинациями параметров. Комбинаций может быть где-то 150 - 1000. Если делать cross join, то соответственно эти 100 млн умножаются еще на эти 150 - 1000 строк и эта история может перестать пролезать по памяти.

Какие есть варианты? Нужно переходить на операции с массивами? Один из вариков, который приходит на ум помимо массивов - это сгенерить sql, где будут перебираться все эти параметры

да нормально должно пролезать...
сделайте

select ...
from pair_prots
cross join 
(select <columns> ligand cross join nu cross join theta cross join lambda)

чтобы внутренний запрос отработал сначала и потом приджойнился

а ligand что за зверь? нет его в комбинациях ваших...

какая версия кх?

ligand - вторая таблица с координатами точек, тк сначала надо сгенерить пары точек и потом уже считать расстояния и формулу

и сколько там строк?

вы как то благополучно решили умолчать об этой детали в вашем тексте...