Да, еще момент, в Deployment status стоит ошибка "конфликт групповых политик" для необновленных клиентов. Скорее всего, дело в этой ошибке, но непонятно, какие именно политики конфликтуют. Ранее обновления раздавались через сервер WSUS, потом эту политику выключили и, по идее, она должна была перезаписаться сервером SCCM...