Вообще-то это вопрос не техдирский, а СЕО-шный. В предпринимательском и менеджерском деле - текучка, не требующая особых рефлексий.
Делаешь подразделение - продумай, зачем оно, как оно будет работать.
Делаешь отдельное юрлицо, - продумай, кто и почему за него в ответе. Если это лакомый кусок для рейдерства, - продумай, как об этом узнаешь и как будешь защищать.