"Сайт - это скорее некий информационный ресурс, не предполагающий какой либо сложной логики и больше ориентирован на отдачу контента. Сайты преимущественно находятся в публичном доступе в Internet.
Веб приложение наоборот, предполагает плотное взаимодействие с пользователем, получение от него "бизнес данных", их сложную обработку и хранение, возможно даже без предоставления результата пользователю. Веб приложения зачастую работают в Intranet.
Пример первого - тот же стек, хабр или фишки в конце концов.
Пример второго - гуглдокс, SAP и т.д.
Веб приложение для работы, сайт для развлечения/поиска информации."
https://ru.stackoverflow.com/a/551049/242718