если уж переменная типа файл то и работайте с ней как с файлом echo $ENV_FILE >> .env не прокатывает вполне закономерно.
чтобы это работало то переменная должна быть переменной а не файлом.
ещё вы пытаетесь этот несчатсный файл прокинуть....вобщем эта переменная будь она файлом или настоящей переменной сущестувут только в окружении где выполняется скрипт пайплайна....вы из этого сеанса по ssh логинитесь на удалённый сервер и ожитаете что эта переменная будет существовать и там тоже.... но это ошибка, о чём вая и говорится