А как их устанавливать? Клик в проводнике выдает поиск приложения для открытия. Надо через терминал и sudo apt install?
Отсутствие Gdeby обусловлено тем, что EOS уходит в сторону FlatPak. Ну и через консоль пакеты устанавливаются через dpkg . apt - консольная утилита для установки с репозитория.