Ребят, я не понимаю вас. До сервера хватило соображалки дорваться, а пару команд в консоли для упроавления БД не можете ввести? Нафиг эти pma и прочие дела. На крайняк можно юзать SQLyog или Sequel Pro на Mac.
На VPS я adminer не использую, но бывают ситуации например к хостингу доступа нет по фтп закинул админер и все или хостинг без phpadmin, adminer выручал не раз. Самое оптимальное наверное удалить после себя его.