Ну, вот у меня прям сейчас под рукой пример, что тормозит - есть большой репозиторий, с файлами из которого мне надо работать. Конкретно меня там касаются три папки, всё остальное мне никак видеть не хочется. Я в эти папки положила по файлу .projectile (и добавила в глобальный gitignore у себя), теперь это типа отдельные проекты и замечательно, а как то же самое донести до project - пока не знаю.