У меня на одном из проектов вообще один раз обнаружился какой-то левый htaccess. Стал разбираться - оказалось, заказчик решил в соответствии с какими-то рекомендациями с какого-то ГС "оптимизировать" сайт для SEO, там вычитал, что "у сайта должны быть файлы robots.txt и htaccess". Сбросил пароли через хостинг, и чеез файловый менеджер влил туда htaccess для Revo какой-то десятилетней версии, упоминаемый в том блоге. Фингя, что кучу редиректов важных именно для SEO отрубил (сайт до этого переезжал, и проблема смены адресов как раз регулярками в htaccess-е решалась), зато оптимизировал все. Так вот, что прикольно, сайт в целом не упал, ну кроме того, что картинки со старых адресов и скачиваемые файлы все отрубились :)