Не а. Если формат разный то не будут. Делаешь обработку. Грузишь в тз ексель. И делай с полями что хочешь и сравнивай как хочешь. Подсветить можно через условнлое оформление
Спросите любого экономиста работающего с excel. Они ВСЕ выгружают из 1С отчеты в excel и там делают сверку. Так как в excel есть для этого множество инструментов. Так что не изобретайте велосипед.