Антибиотик вакцину не нейтрализует, нет. Антибиотики вообще убивают бактерий, которые сами по себе живые организмы, у них внутри тоже ДНК копируется и протекают процессы, они впитывают питательные вещества извне, перерабатывают их на энергию, взаимодействуют с внешним миром, и сами делают копии себя. Вирус это по сути кусочек РНК или ДНК упакованный в коробку, в которой он может поехать до следующий клетки чтобы она уже его приняла и скопировала, он совершенно пассивен, не может ничего делать сам по себе, там не протекают внутри никакие процессы пока он не попал в клетку, и даже живым он не считается. То-есть бактерия (которую убивает антибиотик) принципиально отличается от вируса, и антибиотик на вирус не действует. Но при этом у вакцины есть побочные эффекты, у антибиотика есть побочные эффекты. Вакцина новая, так что возможно ещё нет данных по взаимодействию со всеми лекарствами. Лучше сказать это врачу, они должны знать, является ли приём этого конкретного препарата противопоказанием. Скорее всего - нет.