Раздели компанию рога и копыта на более мелкие "компании" (разделы) и перенеси туда учётки подьзователей
Не совсем понимаю что это может дать. Пользователь видит всех пользователей системы вне зависимости от того в какой он организации находится. Я склоняюсь к версии что это баг. Может кто-нибудь такой ролью менеджера? У всех так работает?