Как выяснилось, у него унутри имеется ажно две разных ARP-таблицы. Одна - системная, нужна для целей маршрутизации. Это которая сидит в "/ip arp print". А вторая, более низкого уровня, используется его аппаратным свитчом в целях разруливания Ethernet-кадров по физическим портам. Её можно посмотреть командой "/interface bridge host print".
Дык вот, несмотря на кажущуюся похожесть, это две абсолютно разные таблицы. Которые никоим образом не зависят друг от друга и не пересекаются. И наличие/остутствие/обновление какого-либо MAC-адреса в одной из них в общем случае никоим образом не затрагивает другую.