Я бы на вашем месте писал авиакомпаниям и может даже в Схипхол, а не искал совета в чатах.
Я бы уточнил в Шереметьево / у аэрофлота. Интерлайн соглашение у Аэрофлота в катарами есть, но если в Европе у меня багаж по двум разным билетами чекинили, то не знаю, как в России на это смотрят. Отдельные билеты, так что они не обязаны это делать.