у тебя сгенерится миграция и ты сразу ее применишь
Если в модели снес поле, и не было ограничений (т.е. если это не внешний клюс) - да, в джанге снесет в базе это поле тоже. Ему сказали снести, он снес. Никто никого не обманывал: что сказали, то он сделал.
Если это запускалось в тестовой среде, ну, уйдешь на второй круг думать. Если в проде - хуже сильно. Но это сделал именно ты, снеся поле в модели. Это логично.
И ручное написание миграций - оно же тоже не панацея от ошибок-то. В том числе грубых и с необратимыми последствиями.