Помнится был плагин, который позволял описать параметры в файле. Файл хранить в той репе где и дженкинсфайл. И тогда можно все подчиненные джобы перевести на использование этого плагина.
И в "главной" джобе получать список репозиториев, читать эти файлы и формировать общий список параметров.