Начиная с релиза Chrome OS 69 внедрена поддержка виртуальной машины Debian GNU/Linux. Данное решение позволит использовать студентам, изучающим языки программирования, различные средства разработки, браузеры, редакторы в специально изолированной безопасной среде.
В июле 2020 года разработчики Chrome OS объявили, что в операционной системе появится полноценная поддержка Windows-приложений. Этого планируется достичь благодаря использованию технологии виртуализации от Parallels. Нововведение позволит запускать Windows-приложения непосредственно в Chrome OS параллельно со стандартными программами без необходимости предварительно запускать среду рабочего стола Windows.