Я в свое время занимался аудитами производительности 1С. Если кратко, то все сводится к следующему:
1. Слабое "железо".
2. Не настроены регламентные задания SQL.
3. Тормозит "железо", но проблема не в "железе", а в плохом коде. Вычисляется специальными приложениями.