Я бы советовал тупо уменьшить количество кадров в секунду на камере, 1к в сек вполне приемлемо. и попробовать снова залить, если проблема уйдет, значит это ПО гоупро. если не уйдет то уже пробовать дальше, скажем 1 кадр в 2с, или действительно загружать только 1 папку.
А может действительно ПО просто заглатывается от количества метаданных в папке, если там 10К-100К фоток.
Мне кажется с количеством материала как у Эдуарда можно было бы найти в чем проблема, и уже Алекса долбить вместе с командой мапиляри на конкретный баг, а не просто у меня не работает нормально. это бы помогло всем, и чат этот стал бы куда конструктивнее )