Потому, что:
1. При установке пакета ntp вы сильно потеряете в функционале нтп-клиента самого микротика.
2. На микротике отсутствует батарейка, что при перезагрузке может раздать клиентам всякий бред.
3. В любом случае Вы получите снижение страты, по сравнению с опросом клиентом напрямую.
4. Иногда нтп-клиент микротика "подвисает" и тогда - см. п.2