Вряд ли микротик такой умный, чтобы для вычисления хеша заглядывать так глубоко в трафик. А значит хеш будет браться только от мак-адресов, ether-type и идентификатору сессии, а значит весь входящий пппое-трафик этой одной сессии попадёт в одно ядро.
Почитай принципы работы пппое и пойми, что там нет "соединения" в понятии тцпип и коннтрека