Да, там будет разное налогообложение - werkstudent платит мед.страховку сам и не платит часть социальных взносов, обычный сотрудник на полставки платит больше взносов и мед.страховка делится (не знаю, что при этом происходит, если она льготная студенческая, а не добровольная). Посчитайте по онлайн-калькуляторам, что вам самой выгоднее