у меня задача в mysql 5.5.6 забить
Тогда из пиждыпи.
Цикл, на 999 999 итераций, просчитывать каждую строку, в массив закидывать 1000 значений, потом объединять массив в строку вида "('n0'), ('n1'), ('n2_2'), ..., ('n999')" (данные строковые, чтобы уже точно, но может и bigint подойдет). id в таблице autoincrement.
И insert с указанием только поля value (id оно само создаст).