Суть такая: как только начинаешь работать над задачей — ставишь хоткой Ctrl+Ж дату, и хоткой Ctrl+Shift+Ж время начала. (контрол и шифт на маковский сами переведите, я не шарю :)
Встал покурить/поесть/пописать, закончил или переключился на другой проект/заказчика — ставишь время окончания (и, возможно, начинаешь новый рабочий промежуток).
Получается список непрерывных рабочих промежутков, по которому легко посчитать суммарное потраченное время.
Потом можно навернуть сверху всякие filter view, чтобы статистику собирать по заказчикам и/или видам работ.