Если коротко - все уже существовало, но потом произошла квантовая флуктуация, которая запустила процесс расширения, потом был большой взрыв, от которого все начало сталкиваться и формировать более сложные элементы. А по поводу массы и энергии, e=mc^2 И чтобы ещё больше добить - масса протона измеряется в единицах энергии 😂