Действительно, если грузить в файловый менджер не работает плагин. А зачем вам обязательно через файловый менеджер? Было время загонялся об порядке в файлах, чтобы менеджеры все по папочкам раскладывали. Бестолку. Потом устраивают срачь всеравно. Поэтому пусть уплоудом грузят в момент создания контента. А файловый менеджер больше для админа порядочного, документов :)