Имхо, виртуализация (kvm, vmm, etc) это вообще не про безопасность. Во первых, гипервизоры дырявы и довольно регулярно. Во вторых, qemu/libvirt и прочее для быстрой работы с железом - ещё большая жопа. В третьих, если хочется не просто запустить приложение в виртуалке, но и шарить ресурсы какие-то с dom0, типа окна приложения из виртуалки - всё ещё хуже.
Лучше уж тогда отдельный user + chroot и что-то ещё там, имхо.