Логично, да.
По идее если ты пилишь под себя, и у тебя включение JVM IR ничего не ломает, это должна быть ок опция. Но, конечно же, в модуле с JVM IR не будет работать всё то же, что не работает в одном модуле с компоузом (не слежу, чё там пока сломано)