Счётчик умерших от COVID-19 во всём мире преодолел отметку в 2 миллиона, а сегодня ВОЗ сообщает об очередном печальном рекорде по смертности (от вируса за неделю в мире умерло 93 тысячи человек)
, но кроме количественных изменений появились и качественные. Вслед за Великобританией о новых штаммах ковида заговорили в Германии и других странах. Как это повлияет на развитие пандемии и планы по вакцинации? Мы попросили к.м.н. Андрея Василькова разъяснить ситуацию.
Сейчас пишут о новых штаммах, вызывающих COVID-19. Сколько их всего?
Мнения на этот счёт разделились. Генетики дают названия любым вирусным клонам с
устойчивым набором мутаций, из-за чего их получается пугающе много.
Инфекционисты и эпидемиологи игнорируют геномные различия до тех пор, пока они не повлияют на клиническую картину, пути и скорость передачи инфекции.
Поэтому в одних статьях пишут о тысячах штаммов, другие авторы фиксируют региональные особенности единичных штаммов (именно они сейчас на слуху), а третьи
настаивают, что штамм по-прежнему один.
Чтобы обойти терминологические споры, говорят о
вариантах SARS-CoV-2.
Как быстро возникают новые? Ранние исследования показали, что в среднем у SARS-CoV-2 накапливается пара нуклеотидных мутаций в месяц. Примерно с середины прошлого года они стали происходить чаще из-за новых факторов эволюции: экспериментального лечения, длительной инкубации в организме людей с иммунодефицитом, передачу через животных (вспомните
датских норок) и карантинные полумеры.
Всего за историю наблюдений SARS-CoV-2 зарегистрировано
свыше 12 тысяч мутаций, но среди них лишь единичные изменения имеют функциональное значение. Например, это
недавно открытые модификации, помогающие вирусу проникать в клетки и прятаться от иммунной системы.
Какие варианты коронавируса преобладают в России?
По данным GISAID (глобальной инициативы открытого доступа к геномным данным вирусов) циркулирующие сейчас варианты SARS-CoV-2 разделены на
12 эволюционных ветвей, называемых кладами (clades).
В России доминирует клада 20B. Она сформировалась в конце февраля 2020 года и ответственна за весенний всплеск заболеваемости, когда ВОЗ объявила пандемию.
Сейчас темп распространения COVID-19 в России снижается, а в отдельных странах нарастает. В основном это влияние более опасных штаммов из новых клад 20D — 20J.
Суперспособности получили
20С/501Y.V1 (Британский вариант);
20H/501Y.V2 (Южноафриканский) и
20J/501Y.V3 (Бразильский). Их наборы мутаций повышают шансы вируса продолжить распространение даже после формирования значительной иммунной прослойки населения.
В чём особенности новых вариантов SARS-CoV-2?
Появились штаммы,
распространяющиеся быстрее в полтора раза. Этим вызван рост числа новых случаев за последние месяцы даже там, где были введены жёсткие ограничения.
Возникли модификации со значительно изменённым S-белком. Одни тесты ОТ-ПЦР их распознают корректно, а другие чаще дают ложный отрицательный результат. Поэтому
ВОЗ рекомендует лабораториям связаться с производителями тестов и прояснить диагностические возможности.
Некоторые мутации помогают SARS-CoV-2
избегать действия антител. Поэтому переливание плазмы выздоровевших пациентов становится менее эффективной тактикой, а длительность иммунитета от ковида постоянно пересматривается.
По этой же причине в Южной Африке повторное заражение предполагается у 21% получивших иммунитет естественным путём. Аналогичная ситуация
развивается в Бразилии, Колумбии и Перу.
Новые варианты SARS-CoV-2 с ускоренным распространением и улучшенной маскировкой от иммунной системы постепенно вытесняют другие. Это позволит вирусу прочнее закрепиться в популяции и вынудит нас разрабатывать новые меры сдерживания пандемии.
Означает ли наличие новых штаммов снижение эффективности вакцин?
Вряд ли. Большинство вакцин основаны на большом антигенном наборе, на который слабо влияют точечные мутации. К тому же, его всегда можно обновить, как это ежегодно делается с вакцинами от гриппа. Pfizer уже
заявила, что вакцина BNT162 способствует выработке антител, эффективных против нескольких вариантов SARS-CoV-2.