Нумба работает при запуска, а cython компилируется под конкретную платформу, это раз. Два - cython обрабатывает весь код и предлагает писать код с типами и использовать несовместимый с питоном синтаксис в роде cdef и прочего. Три - нумба сдохнет при работе со строками и будет притормаживать при работе с непростыми типами. Четыре - тебя подъебет матеша, когда вылезешь за 64 бита. Рраунд