AP
сталкивался с ситуацией, когда при запуске из терминала скрипт не отрабатывал, а при отладке в рстудио все было вроде ок – решилось сохранением скрипта в енкодинге CP1251 (синхронно с виндой), попробуйте такое, если еще нет. или можно поиграться с iconv