или там в исходном веторе не строка, а фактор и он ломается..

x_1<-as.Date(msft$date, "%d.%m.%y")

%Y

Я его сюда вроде скидывал

Сорян, буду искать ссылки в канале перед тем как постить

GRanges object with 1 range and 2 metadata columns:
     seqnames            ranges strand |      symbol      ensembl_id
        <Rle>         <IRanges>  <Rle> | <character>     <character>
 [1]       11 64570982-64578766      * |        MEN1 ENSG00000133895
 -------
 seqinfo: 1 sequence from an unspecified genome; no seqlengths

Не стоит благодарностей.

Я хочу сделать улучшенный датафрейм для пакета с помощью S3. Смысл в том, чтобы иметь в основе обычный датафрейм, но с некоторыми кастомными атрибутами. Смысл в том, чтобы сделать осмысленный summary() и, возможно, plot() для этих данных (это данные враппера API). Ну и этот класс хотелось бы сделать data.table/tidy friendly. Но пока что получается, что при использовании setDT()`/`as.data.table() или tibble() класс тупо теряется и мой прекрасный содержательный summary() заменяется страшным стандартным summary.data.frame(). Можно ли с этим что-то сделать? Или лучше не выпендриваться так, а по возможности не мудрить с S3 и поступить как большевики.

надо дополнительно методы для вашего класса as.data.table as_tibble, чтобы информация о классе не терялась .  Можно даже наследоваться от кого-то из них. Тогда атрибут класса будет c("my_class", "data.table")