К
там есть ген MAFB, он не относится к гену MAF)
Size: a a a
2021 April 09
a
скорее не ясно. Выше или ниже 2 — т. е. неравное 2? Звучит как задача на фильтрование данных
ДВ
Просто совет для того, чтобы лучше понимали вас. Выше или ниже - это просто не равно))
К
извините, чет в своих мыслях. Да, не равно двум
ДВ
В итоге нужны просто все значения из колонки gene, для которых в соостветсвующей строке в колонке predLargeSeg значение не равно 2?
К
Но как видите, первые две строки имеют значения 2, они тоже должны быть включены, так как в данном гене есть значения не равные двум
ДВ
То есть группировка по гену)
К
Да
К
Это вроде можно в tidyverse сделать но я пока в нем не оч
ЮМ
df %>%
group_by(gene) %>%
filter(predLargeSeg != 2)К
видимо мне нужно как можно быстрее его освоить)
К
спасибо! попробуем)
a
не, вроде писали, что значения с 2 тоже нужны, так что я бы просто сделал дополнительный столбец, который проверяет, есть ли гены с значениями отличными 2, а потом уже выводил все значения по списку генов
a
library(tidyverse)
df <- tibble(gene = c("a", "a", "b", "b", "b", "c"),
value = c(2, 3, 3, 4, 5, 2))
df %>%
filter(value != 2) %>%
pull(gene) %>%
unique() ->
our_genes
df %>%
filter(gene %in% our_genes)
К
Да, тоже нужны если в гене есть значения не равные двум
ДВ
Короче, формулировка задачи такая: удалить все гены, у которых значение predLargeSeg только 2 и всё)
К
yes
К
исключить)
ДВ
df %>% group_by(gene) %>% filter(length(unique(predLargeSeg)) != 1 & min(predLargeSeg) != 2)