Успешно развивается также военно-техническое сотрудничество двух стран. В 2004 году был заключён контракт на поставку в Азербайджан израильского вооружения, произведённого в Турции[3]. По данным WikiLeaks в сентябре 2008 года Израиль и Азербайджан подписали соглашение, согласно которому компания Soltam получила контракт на поставку азербайджанской армии минометов и боеприпасов, Tadiran Communications — устройств связи, а Israel Military Industries — широкий спектр ракет и систем наведения[31].
В 2009 году израильская оборонная компания Elbit Systems открыла представительство в Азербайджане, а Министерство оборонной промышленности Азербайджана начинает производство БПЛА[32].
В 2012 году Азербайджан приобрёл у Израиля БПЛА и системы ПВО на сумму 1,6 млрд долларов[33].
В сентябре 2014 года министр обороны Государства Израиль Моше Яалон стал первым израильским главой оборонного ведомства, который посетил Азербайджан[34][35].
В сентябре 2017 года Израиль с официальным визитом посетил министр обороны Азербайджана генерал-полковник Закир Гасанов [36]. В июле 2018 года Азербайджан посетила израильская делегация во главе с председателем совета директоров компании «Aeronautics» Едидией Яари. Она встретилась с Яхьей Мусаевым, заместителем министра оборонной промышленности Азербайджана. На встрече обсуждалась деятельность компании «AZAD Systems», которая является совместным проектом двух стран по созданию беспилотной авиатехники. По окончании встречи был подписан протокол о намерениях[37].
В сентябре 2018 года в Азербайджан с официальным визитом прибыл министр обороны Израиля Авигдор Либерман. Он встретился и провел многочасовые переговоры с президентом Азербайджана[38], министром обороны, министром по чрезвычайным ситуациям, командующим Погранвойсками республики, главой внешнеполитического ведомства Азербайджана, премьер-министром и вице-премьером страны[39].
В октябре того же года Израиль посетил начальник генштаба, первый заместитель министра обороны Азербайджана генерал-полковник Наджмеддин Садыгов. Генерал Садыгов встретился со своим израильским коллегой Гади Айзенкотом и высшим командованием. В рамках визита он посетит различные подразделения израильской армии и обсудит укрепление военных связей, а также сделки в сфере безопасности между двумя странами[40].
В январе 2019 года стало известно, что Израиль поставит Азербайджану партию тактических барражирующих боеприпасов последнего поколения «Sky Striker». Азербайджан стал первым иностранным покупателем «Sky Striker»[41][42].