ну, так-то сейчас забавная ситуация, что формально нет вообще методики моделирования, которая утверждена и удовлетворяет всем требованиям подзаконным актов (21, 17 приказу, 239 и т.д.). Та же методика 2008 года не использует БДУ например, там другие понятия в принципе, так что ее as is использовать некорректно.
Есть опыт согласования МУ ГИС с ФСТЭК и ФСБ, разработанной по проекту 2015 года. Сейчас аналогично можно делать МУ по проекту новой методы, но в явном виде на нее не ссылаться, пока она не утверждена. Так, уже в этом году при согласовании ФСТЭК просил расписывать сценарии реализации угроз, что как бы про новую методик уже
Также и модели угроз по методике 2008 года с учетом БДУ согласуют (в т.ч. ГИС, ПДн и КИИ) =)
Я же говорю, что если в ТЗ явно не прописано, что надо делать по не утвержденной методике, то этого делать нельзя. Если, например, в ТЗ прописать, что в модели должны учитываться сценарии реализации угроз и т.п., то тут да можно её использовать без прямых ссылок